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La végétation de l’embouchure combine des espèces riveraines et côtières, avec une prédominance de joncs, de totoras et de prairies halophiles adaptées à l’influence saline de l’océan. Dans les zones plus élevées, on trouve des arbustes tels que le calafate et le chañar, ainsi que des espèces caractéristiques de la steppe patagonienne qui entoure la région. Cette diversité végétale contribue au maintien d’un écosystème équilibré soutenant la faune locale.
L’embouchure du río Negro est une zone importante pour la faune locale, en particulier pour les oiseaux migrateurs et résidents. On peut y observer des espèces telles que des hérons, des goélands, des bécasseaux et d’autres oiseaux côtiers qui trouvent dans cet écosystème un lieu d’alimentation et de repos. De plus, la zone constitue un habitat pour de petits mammifères et des reptiles adaptés aux milieux riverains et côtiers.
